Ökaryotik hücreler prokaryotik hücrelerden, özellikle boyut, karmaşıklık ve işbirlikçi davranış gibi çeşitli şekillerde farklılık gösterir. Ökaryotlar ve prokaryotlar arasındaki bölünme, iki sınıf sınıflandırılmış yaşam alanı ile doğanın en derin bölümüdür prokaryotik ve sadece bir ökaryot grubu olarak.
Tüm hayvan, bitki, mantar ve protist hücreler ökaryotiktir. Genetik materyalleri gizli bir çekirdekte bulunur ve sitoplazmalarında tanımlanabilir organellere ve diğer yapılara sahiptirler. Ökaryotlar ayrıca prokaryotlardan birçok kez daha büyük olma eğilimindedir. Prokaryotik hücreler çekirdek ve organellerden yoksundur ve genetik materyalleri ökaryotun çoklu lineer kromozomlarından ziyade halka şeklinde tek bir kromozomdan oluşur. Prokaryotik hücre duvarlarında aktarma proteinleri ve sinyal için yararlı olan diğer yapılar bulunmaz.
Davranışsal olarak, iki hücre tipi çok farklıdır. Prokaryotik organizmalar, konjugasyon olarak bilinen bir işlemle çoğalırlar, böylece iki hücre, birbirlerini hücrede serbestçe yüzen bazı genetik materyallerden geçirirler. Ökaryotik organizmalar, tüm DNA zincirini ayıran ve yarısını yavrulara geçiren çok daha karmaşık bir hücre bölünmesi şekli olan mayoz yoluyla çoğalırlar.
İki tür arasındaki diğer önemli fark, birlikte çalışma dereceleridir. Bazı prokaryotlar toplum içinde yaşarken, yalnızca ökaryotlar gerçek çok hücreliğe dönüşmüştür. Dünyadaki tüm büyük organizmalar ökaryottur ve hepsi bir prokaryot ile olduğundan daha yakından ilgilidir.
