Bir Nintendo 64 sisteminin değeri, 2014 yılı itibariyle 28 ila 999,99 ABD doları arasında değişmektedir. Fiyat, sistemin modeline, rengine ve durumuna göre değişir. Nintendo 64 sistemleri hala orijinal ambalajlarındaysa daha değerlidir.
En düşük değere sahip model, kullanılmış durumda Nintendo 64 standart sistemdir. En değerli model, orijinal ambalajındaki Atomic Black Nintendo 64 sistemidir. Bir Nintendo 64 açıldıktan sonra değeri çarpıcı bir şekilde düşer. Atomic Black Nintendo 64 sistemi kullanılmış durumda 59.39 dolar ve yeni durumda 999.99 dolar değerinde. Nintendo 64 sistemleri çevrimiçi olarak ve ülke genelindeki elektronik satış mağazalarında satılmaktadır.