Neptün'ün atmosferi diğer büyük gezegenlerin atmosferlerine benziyor ve helyum ve hidrojen içeriyor. Ayrıca iz su, amonyak, metan ve diğer buzları içerir.
Neptün'de atmosfer yüzde 80 hidrojen, yüzde 19 helyum ve yüzde 1,5 metan ve etandır. Atmosferin geri kalan kısmı, milyonlarca hidrojen gütürit için 192 parçadan oluşur.
Neptün, güneş sistemindeki sekizinci gezegendir. Atmosferi Uranüs'ünkiyle karşılaştırılabilir. Neptün, evrendeki en şiddetli havaların bazılarına sahiptir ve bulutlar katlıdır. Gezegenin, saatte 1.305 mil rüzgar var, bu da Dünya'daki en güçlü rüzgarlardan dokuz kat daha hızlı.