Mercan resifinin abiyotik faktörleri arasında güneş ışığı, oksijen, karbondioksit ve su bulunur. Abiyotik faktörler mercan resiflerine yakın, canlı olmayan, ancak sağlığını ve hayatını etkileyebilen etmenlerdir.
Abiyotik faktörlerin biyolojik olmayan olmasına rağmen, mercan resiflerinin refahı üzerinde hala büyük bir etkisi olabilir. Örneğin, küresel ısınmadan dolayı değişen koşullar, tüm ekosistemin dengesini etkileyebilir, mercan resiflerine ve çevresindeki alanlara zarar verir. Abiyotik faktörlerde çok fazla değişiklik olması, güneş ışığının resiflere ulaşma miktarını etkileyebilir ve bu da bir mercanın ne kadar yiyeceğe sahip olduğunu etkiler.