Çoğu mağara, karst olarak bilinen belirli bir manzarada yapılır. Alçı kayalar, kalker ve dolomit, mağaralar oluşturmak için asidik yağmurla çözülür. Mağaraların çoğu insanı barındıracak kadar büyük hale gelmek 100.000 yıldan fazla zaman alır. Birbirine bağlı yeraltı yolları sisteminde pek çok mağara vardır.
Su erozyonuna ek olarak mağaralar basınç, kimyasal reaksiyonlar, volkanik kuvvetler, mikroorganizmalar ve tektonik hareketlerden oluşur. Kıyılarda gelgit hareketi ile oluşturulan mağaralar deniz mağaraları olarak bilinir. Buzları eritmek buzul mağaraları yaratabilir.
İnsanlar tarih boyunca mağaralar, sanat tuvalleri, dini törenler için yerler ve mezarlar olarak mağaralar kullandılar. Jesse James gibi suçlular, mağaraları çalınan malları saklamak için bir saklanma yeri ve yer olarak kullandılar.
Amerika Birleşik Devletleri'nde 55.500'den fazla mağara var. Missouri eyaletinde 6.000'den fazla mağara bulunmaktadır. Ülkedeki en ünlü mağaralardan bazıları; Carlsbad Mağaraları, Meramec Mağaraları, Mamut Mağarası ve Jewel Mağarası. Niagara Mağarası 400 milyon yıllık eski fosiller içermektedir. Gürcistan, dünyanın en derin mağarası olan Voronya Mağarası'na ev sahipliği yapmaktadır. Mağara keşfi içeren hobiler heceleme, mağaracılık ve çukurlaşma olarak bilinir. Speleoloji mağaraların incelenmesidir.