Köpek balıkları bir dereceye kadar yiyeceği insanlara benzer şekilde sindirir. Yiyecekler, enzimler ve diğer biyo-ajanların bozduğu mideye alınır. Bu işlem tamamlandıktan sonra, ortaya çıkan madde bağırsaklara yönlendirilir; Bununla birlikte, köpekbalığı sistemi yuttuğu, besin değeri sağlamayan veya sindirimi için çok büyük olan şeyleri ayırt etme yeteneğine sahiptir. Bu gibi durumlarda fazlalık atılır.
Köpekbalıkları sık sık bütünleri veya oldukça büyük parçalarını yutar. Bu nedenle tüm arıza köpekbalığının U şeklindeki midesinde meydana gelmelidir. Büyük Beyaz gibi bazı köpek balıklarının yemek borusu ya da avın mideye ulaşmadan kaçmasını engelleyen uzantıları vardır. Midedeki enzimler ve diğer asitler, yutulan materyali, bağırsaklarda sindirilmeye hazır olan kalın, çamurlu bir maddeye dönüştürmek için çalışır. Bu çorba malzemesinin mümkün olduğu kadar duygusal olması gereklidir, çünkü köpekbalığının midesinden bağırsaklarına giden vana, pilorik vana oldukça küçüktür ve malzemeyi başka türlü kabul etmeyecektir. Köpekbalığı, valften geçebilecek kadar kolay parçalanmayan kemikler gibi herhangi bir malzemeyi kusabilir. Daha sonra besinler köpekbalığı bağırsaklarından emilir ve fazla atık atılır.