Konfederasyon Ordusu baş komutanı 1861'den 1865'e kadar Amerika Konfedere Devletleri'nin başkanı olan Jefferson Davis'ti. Bazı ünlü Konfederasyon generalleri Robert E. Lee, John Bell Hood, Thomas "Stonewall" Jackson ve Braxton Bragg idi.
Bragg, 1862'de Tennessee Ordusunu yönetirken, Jackson İlk Boğa Koşusu Savaşı'nda savaştı. General Lee, İç Savaş sırasında çok önemli bir komutandı. Savaşın sonunda, Appomattox'taki Konfederasyon kuvvetlerinin sonunu 1865 Nisan'ında General Ulysses S. Grant'e teslim etti.
İç Savaş 1861 ile 1865 arasında sürmüştür. Yaklaşık 620.000 askerin öldüğü maliyetli bir savaştı.
