Tek tek genleri bakteri veya ökaryotik hücrelere sokmak için en yaygın kullanılan vektör, Scitable'a göre bir plazmiddir. konak hücresinin her üreme döngüsü sırasında.
Plazmidler, "Moleküler Hücre Biyolojisi" ne göre birkaç yüz DNA baz çiftinden maksimum 100 kilobaz çiftine kadar taşıyabilir. Bu boyut aralığı, insan genomunda bugüne kadar tespit edilen hemen hemen her geni kapsar.
1980'lerde, genetik mühendisleri "kozmid" adı verilen bir plazmid varyantı geliştirdiler. Bu vektör, DNA'nın bir "bakteriyofaj" olarak adlandırılan bir virüse paketlenmesini sağlayan "cos siteleri" adı verilen özel eklere sahip bir plazmidden oluşur. Fikir kağıt üzerinde iyi çalışsa da, bilim adamları bakterilerin sıklıkla bir bakteriyofaj virüsüne yanıt verdikleri gibi kozmidlere cevap verdiklerini keşfettiler. Kozmidin bu yönü, bakterilere genleri sokmak için kullanma noktasını yitirir.
Bazı deneylerde, biyologlar bir kromozomun tüm parçalarını klonlamak veya çoklu genlerin bir hücre çizgisi üzerindeki etkilerini görmek istedi. DNA'nın 100 kB'den daha uzun olması, bakteriyel bir yapay kromozom veya bir maya yapay kromozomu gibi farklı bir vektörün kullanılmasını gerektirir. Bir BAC 300 kB'ye kadar DNA taşıyabilirken, YAC herhangi bir plazmidin taşıyabileceği miktarın 10 katı olan 1000 kB'ye kadar DNA taşıyabilir.