Genetiği değiştirilmiş hayvanların bir avantajı, Michigan Eyalet Üniversitesi Hayvan ve Hukuk Tarihi Merkezine göre, doğal hayvanlardan daha hızlı ve daha büyüyerek daha verimli üretebilmeleridir. Genetiği değiştiren hayvanların bir dezavantajı, türleri yeni tür bulaşıcı hastalıklara karşı daha savunmasız hale getirerek türlerin genetik çeşitliliğini azaltmasıdır.
Michigan State Üniversitesi,Hayvanlardaki stres genlerini silme ve onları bilinçsiz yapma yeteneği, genetik mühendislik yapan hayvanların olası bir avantajıdır. Bu, hayvanı acı hissetme kabiliyetine sahip kılmamakta ve endüstriyel bir yaşamda uygulanan acıyı potansiyel olarak ortadan kaldırmaktadır. Bazıları fabrikaları hayvanlar için daha da kötü hale getirip acılarını artırabildiğinden, bunun bir dezavantaj olduğunu düşünebilir. Genetik mühendisliği savunucuları, aynı zamanda bir hayvanı kendi duyarlılığından mahrum etmenin ahlaksız olduğunu düşünüyor.
Genetiği değiştirilmiş hayvanlar, kalıtsal meme kanseri gibi bilinen hastalıklara daha iyi direnebilir, Michigan State Üniversitesi'ne haber veriyor. Bu, bilim insanlarının belirli hastalıkları daha hızlı ve daha ucuz bir şekilde daha doğru bir şekilde araştırmalarını sağlar. Diğer bir avantaj, bilim adamlarının, genetik olarak yeni terapötik ilaçlar oluşturmak için kullanılan karmaşık insan proteinleri üretmek için hayvanları tasarlayabilmeleridir. Bu karmaşık insan proteinlerini üretme yöntemi ucuzdur, üretimi daha kolaydır ve toplu üretilir ve geleneksel yöntemlere göre daha az hayvan fedakarlığıyla sonuçlanabilir.
Genetiği değiştirilmiş hayvanlar, eğer işlenmiş hayvanlar vahşi alana kaçarlarsa, aynı türün vahşi popülasyonlarını azaltabilir, Michigan Eyalet Üniversitesini belirtir. Ayrıca doğal çevreye zarar verebilirler.