I. faz ve faz II arasındaki en büyük fark, faz II sırasında gerçekleşen, ancak faz II'de tekrarlanmayan genetik rekombinasyon sürecidir. kromatidlerin genetik bilgi alışverişinde bulundukları süreçtir. Bu süreç I. fazda gerçekleştiğinden, faz II'de tekrarlanması gerekmez.
Faz I ve II, genetik varyasyon oluşturan seks hücrelerinin veya gametlerin üretilmesinden sorumlu hücre bölünmesi olan iki fazlı mayoz sürecinin ilk aşamalarıdır. Elde edilen gametlerin her biri, orijinal ana hücreden genetik materyalin yarısına sahiptir. Prentice Hall'a göre, I. fazda iki kardeş olmayan kromatid bir tetrad oluşturmak ve genetik bilgi alışverişinde bulunmak için sıraya giriyor. Her kardeş olmayan kromatid bir baba hücresinden ve maternal hücreden geldiğinden, her hücre diğerinden geçerken veya bilgi alışverişinde bulunurken genetik çeşitlilik yaratılır. Bu işlemin süresi nedeniyle, faz 1, iki parçalı mayoz süreci için yüzde 90'ını tüketir; bu nedenle, I fazı, II fazından çok daha uzundur.
Mayozun II. faz olarak bilinen mayozun ikinci safhasında meydana gelen faz II sırasında nükleer zarf bozulur ve mil tertibatı oluşur. Ardından, kromozomlar hücrenin ortasından aşağı göç etmeye başlar. Bu işlemler I. fazda da gerçekleşir.