Epigeal çimlenmede, filizlenen tohum yaprakları toprak seviyesinin üzerine yükselirken, hipogeal çimlenme sırasında tohum yaprakları tohumdan çıkar ve yer altında veya yer seviyesinde kalır. Tohumdan çıkan tohum yaprakları çimlenme sırasında palto kotiledonlar denir. Tohum çimlenmesi, yeterli toprak koşullarına, suya ve ışığa maruz kaldığında bir tohumun büyümesidir.
Hipogeal çimlenmede kotiledonlar, tohum gelişimini beslemek için yeterli besin içeren tohumdan ortaya çıkar ve fotosentetik değildir. Bu tohumlar genellikle epigeal tohumlardan daha büyüktür. Fide büyüdükçe, filizlenmeleri zemin seviyesinin üzerine çıkar, kotiledonlar ise yer seviyesinin altında veya yer seviyesinde kalır.
Epigeal çimlenmede kotiledonlar, fide büyüdükçe yer seviyesinin üzerinde ortaya çıkar ve yükselir. Ayrıca fide gelişiminde fotosentetik bir rol oynayabilirler. Bu şekilde hızla gelişen fideler her ikisi de daha fazla gelişmeyi sağlamak için fotosentez yapan her ikisi de bir sürgün ve yaprak oluşturur.