Enzimler, aktivasyon oranlarını düşürerek kimyasal reaksiyonları hızlandırır. Genel olarak, potansiyel bir reaksiyonun sahip olduğu aktivasyon enerjisinin miktarı ne kadar düşükse, reaksiyon oranı o kadar hızlı olacaktır. Enzimler, reaksiyon işlemi sırasında şekil değiştirerek aktivasyon hızlarını verimli bir şekilde azaltmalarına izin verir.
Enzimler şekil değiştirdiğinde, süreç indüklenmiş bir uyum olarak adlandırılır. Bu işlem sırasında, enzimler temel olarak kimyasal reaksiyonlarda diğer enzimlerle bağlanmak için fiziksel dönüşümlere uğrarlar. Bu enzimler, bir bulmacayı tamamlama işlemi gibi, tam reaksiyonlar oluşturmak için benzer enzimlerle bir araya gelirler. Enzimler ayrıca, substratların bağlanmasını sağlayan enzim yüzeyleri üzerinde konumlanan sıcak noktalar veya aktif bölgeler içerir. Bu siteler aynı zamanda kimyasal reaksiyonların gerçekleşmesi için ev sahibi yerler olarak da görev yapar: noktalar faaliyetin merkezini oluşturur ve hayati değişimlerin gerçekleşmesini sağlayan tren istasyonları veya otobüs terminalleri gibi çalışır. Bu kimyasal reaksiyonlar, substratların bağlandığı enzim yüzeylerinde meydana gelir. Enzim aktif bölgeleri, sonuçta hızlı kimyasal reaksiyonları desteklemelerine izin veren çok daha zayıf reaksiyonlarla (örneğin hidrofobik temaslar, hidrojen bağları ve elektrostatik etkileşimler) stabilize edilir. Kimyasal reaksiyonlar da içsel bir değişiklik gerektirir: bu, yüzeye yükselen ve aktif bölgelere bağlanan enzimler içinde substratların oluşmasıyla mümkün olur.
