Enzimler, peptit bağlarıyla birbirine bağlanmış amino asit zincirlerinden oluşan proteinlerdir. Bir enzim molekülü, bu polipeptit zincirlerinden bir veya daha fazlasına sahip olabilir.
Polipeptit zincirlerindeki amino asitlerin dizilimi, her enzimde farklıdır ve bu, zincirlerin katlandığı benzersiz üç boyutlu şekli belirleyen şeydir. Aktivitelerini belirleyen, enzimin bu üç boyutlu yapısıdır.
Birçok enzim ayrıca bir koenzim veya kofaktör olarak adlandırılan ekstra bir protein olmayan bileşen içerir. Bu bir organik molekül veya bir metal iyonu olabilir. Bazı enzimler, proteine yakından bağlanan koenzimlere sahipken, diğerleri ise hızlı bir şekilde ayrışan koenzimler içerir. Bu koenzimlerin bir enzim çalışması yapması gerekir.
Çoğu enzim açılabilir veya etkisiz hale getirilebilir. Peptid zincirlerinin açılması, yüksek sıcaklıklara veya asit veya alkali koşullara maruz kalmaları durumunda mümkündür. Buna denatürasyon denir. Enzim denatürasyonu geri dönüşümlü veya geri dönüşsüz olabilir; ancak, bu enzime bağlıdır.
Bir enzimi belirli bir sıcaklığın ötesine ısıtmak, enzimi kalıcı olarak tahrip eder. Çoğu enzim doğru sıcaklıkta ve pH'da iyi çalışır. Örneğin, pepsin enzimi, pH 1.5 civarında olduğunda en iyi şekilde çalışır. Bununla birlikte, sıcaklık ve pH doğru olmadığı sürece çoğu enzim çalışmayacaktır.