Ekolojistler, gerçek ekosistemleri test ederek yanıtlanması imkansız, pratik olmayan veya etik olmayan soruları incelemek için habitat ve ekosistem modelleri oluştururlar. Ekosistemler benzer uyaranlarla karşılaştığında. BioScience'daki bir makaleye göre, modeller genellikle şaşırtıcı ve beklenmedik sonuçlar verir.
Örneğin, bir ekolojist, enerjinin küçük bir gölet ekosisteminden nasıl aktığını belirlemeye çalışan bir model yaratabilir. Buna göre bilim insanı, güneş, suya seyahat eden canlılar ve havuzda batan bitki maddesi gibi ekosisteme giren tüm çeşitli yöntemleri hesaba katacak şekilde modeli tasarlamak zorunda kalacaktı. Ek olarak, ekolojist, modelin, hayvanların göletten ayrıldığı zamanlar gibi enerjinin ekosistemden ayrılma yollarını açıklamasını sağlamalıdır.
Modeller, doğal dünyanın mükemmel rekreasyonları değildir ve bazen daha sonra yanlış olduğu kanıtlanan sonuçları verir. Bu, birçok ekolojistin gerçek dünyayı doğru bir şekilde yansıtan bir modelin peşinde periyodik olarak modellerini değiştirmesine neden olur. Modeller ekolojide bu kadar yaygın kullanıldığından, Birleşik Krallık'taki Ulusal Kariyer Hizmetleri, olası ekolojistlerin bilgisayarlarla ilgili çalışma bilgisine sahip olmalarını önerir.
