İnsan beyninin birkaç bölümü vardır ve her birinin ayrı bir rengi vardır. Korteksin yüzeyi genellikle altındaki miyelin kılıflı sinirlerden ayırmak için gri madde olarak adlandırılır. çok daha parlak bir beyaz.
Nöronların bazal ganglionları, neuromelanin adı verilen ve onları siyah yapan özel bir pigment içerir. Bu bölgelere Latincede vakti nigra veya "kara madde" denir. Beyin ayrıca her bir bölümünü besleyen ayrıntılı kan damarları ağlarıyla ağır biçimde damarlanır. Bu damarlardaki kan, yaşayan beynin dokularının çoğuna kırmızımsı veya pembe bir ton verir.