Beyin sapı, yaşam için gerekli olan birkaç temel bedensel işlemi kontrol eder. Brain-Guide.org'a göre, beyin sapı, solunum, sindirim, kalp atış hızı, kan basıncı ve uyarılma gibi aktiviteleri düzenlediği için insan vücudu için bir otopilot görevi görür. Ek olarak, omuriliğin birleştiği noktada bulunan beyin sapı, içinden bilgi ve talimatların geçtiği bir kanal görevi görür.
Brain-Guide.org, üç ana bileşenin beyin sapını oluşturduğunu açıklar. Medulla oblongata, birçok refleks eylemini kontrol eder. Bunlara öksürük, yutma ve kusma sayılabilir. Ek olarak, medulla oblongata bir röle sistemi olarak hizmet eder ve beyine sinir dürtülerinin taşınmasında büyük rol oynar. Sonunda, medulla oblongata kalp, solunum ve motor fonksiyonları kontrol eder.
Vücudun görsel ve işitsel refleks merkezleri, beyin sapının orta beyin olarak adlandırılan kısmında bulunur. Brain-Guide.org, beynin sapının üçüncü ve son kısmı olan pons'un vücudun solunum refleksini kontrol eden solunum merkezini içerdiğini söylüyor. Pons ayrıca beyne ve beyinden dürtü taşıyan başka bir röle merkezi olarak da hizmet eder. Pons, medulla oblongata ile beynin ileri kısımlarına yüksek kortikal yapılar denilen mesajlar arasında mesajlar taşır.
