Bakteriler, difüzyonla yarı geçirgen membranlarından atıklardan kurtulur. Atık organizmadan sıvı veya gaz halinde dışarı atılır. Bakteriler tarafından salınan atıklar genellikle toksiktir ve insanları hasta eden de budur.
Difüzyon, moleküllerin hücreye girip çıkma işlemidir. Çoğu hücrede, organizmanın hangi maddelere girip çıkacağını kontrol eden hücre membranları bulunur. Bakteriler toksik atıkları serbest bırakıp canlılarda hastalıklara neden olabilse de, ilaç yapımında, midenin sindirimine ve süt ürünlerinin üretilmesinde yardımcı olabilir. Bakteriler her yerdedir ve her koşulda yaşayabilir.