Bakırın atom numarası 29'dur, yani 29 elektron içerdiği anlamına gelir. Elektronlar negatif olarak yüklendiğinden, onları dengelemek için eşit sayıda pozitif yüklü protona ihtiyaçları vardır, bu da bakırın çekirdeğinde 29 proton olduğu anlamına gelir.
Bakırın toplam 29 elektronu olmasına rağmen, dış kabuğunda yalnızca bir elektron vardır. Bu, bakırın yüksek oranda reaktif olmasını sağlar, çünkü bu yalnız elektron, bakırdan başka bir atoma kolayca hareket edebilir. 29 protona ek olarak, bir bakır atomu çekirdeğinde 35 nötron da içerir. Proton ve nötronların birleşimi bakırın 63.55 atomik kütlesini verir.
