Ayrıştırıcıların azot döngüsündeki rolü azotu amonyak haline getirerek geri dönüştürmektir. Amonyak toprağa döndürülür ve azot döngüsünün tekrar başlamasını sağlar. Bu aşamada az miktarda azot atmosfere geri döndürülür.
Azot döngüsü, sabit bir azot formunu üreten beş aşamalı bir işlemdir. Organizmalar amino asit üretmek için bu azot formunu kullanır. İlk adımda, nitrojen tespit eden bakteriler atmosferden nitrojeni alır ve amonyak üretmek için kullanır. Diğer bakteriyel organizmalar, amonyak, nitratlar ve nitritler denilen bileşikleri üretmek için kullanır. Bu bileşikler oksijen ve azot içerir.
Bitkiler, amino asitleri üretmek için nitratları ve nitritleri kullanır. Otçullar ve omnivorlar bitki yediğinde, bitkilerde amino asitleri kendi amino asitlerini yapmak için kullanırlar. Bu bileşikler proteinlerin yapı taşlarıdır. Ayrıştırıcılar daha sonra ölü veya çürüyen organizmalarda azotu amonyağa dönüştürür. Denitrifiye edici bakteriler denitrifikasyon denilen zıt bir sürece katılırlar. Bu bakteriyel organizmalar nitratı nitrojen gazına indirgeyerek gazı atmosfere geri bırakır.
Nitrojen döngüsü yaşam için önemlidir çünkü çoğu organizma atmosferik nitrojen kullanamaz. Bu döngü, nitrojeni bitkilere amonyum iyonları, nitrat iyonları ve üre formunda sağlar. Daha sonra hayvanlar, bitki yiyerek veya bitki yiyen organizmalarla beslenerek ihtiyaç duydukları nitrojeni elde ederler.