Asit yağmuru, ortamlarının pH'ını değiştirerek hayvanları etkiler. Asitlik, anatomik değişikliklere neden olur, bazı organizmaların popülasyonunu azaltır ve bazı türlerde üremeyi etkileyebilir.
National Geographic, asit yağmurunu yüksek seviyelerde sülfürik ve nitrik asit içeren her türlü yağış olarak tanımlar. Asit yağmuru Dünya'ya ulaştığında, asitler toprağa batar ve nehirler, göller ve akarsular gibi su sistemlerine girer. Sucul ekosistemlerde asit yağmuru, suyun asitliğini artırarak hayvanlara zarar verir. Bu, çevredeki topraklardan emilen alüminyum miktarını arttırır, bu da sudaki su hayvanları için zehirlidir. Suyun pH'ının beşin altına düştüğü bölgelerde daha az kerevit ve böcek vardır. Artan asitlik ayrıca balığın büyüme hızını ve üreme özelliklerini de etkiler.
Asit yağmuru ormandaki canlıları da etkiler. Yağmur, toprak pH'ındaki değişiklikleri teşvik ederek ağaçların suyu emmesini zorlaştırır. Asit yağmuru etkileri, ağaçlar ve diğer bitkilerin hastalıklara, böceklerin zarar görmesine ve sıcaklık değişimlerine dayanmasını zorlaştırır. Zarar görmüş ağaçlar ve bitkiler öldüğünde, orman ekosisteminde yaşayan hayvanlara bu kadar yiyecek verilmemektedir.