Tatlı su biyomlarının havası ekosistemin türüne bağlı olarak değişir; göletler ve göller mevsimsel değişimlerle ılımlı sıcaklıklara sahiptir; sulak alanlar ise daha sıcak, nemli bölgelerde bulunur. Göller ve büyük göletler gibi biyomlardaki bazı daha büyük su kütleleri, çevreleyen hava sıcaklığını ve nem seviyelerini bisiklet sıcağına düşürerek çevreleyen havaya ısı enerjisi. Küçük nehirler ve akarsular gibi diğerleri, yerel koşullara bağlı olarak fiziksel form ve sıcaklıkta değişen ortamlarından etkilenir.
Tatlı su biyomlarındaki hava koşulları mevsimlere ve coğrafi bölgelere göre değişir. Bazı göletler ve göller mevsimsel olarak oluşur ve bol bahar ve yaz yağmuru ile doğal yatakları doldurur. Ekstra nem havaya buharlaşır, sıcaklıkları ılımlılaştırır ve sis ve sis gibi yerel koşullar üretir. Bu su kütlelerinde suyun sıcaklığı mevsim ile birlikte dalgalanarak fiziksel bileşimi değiştirir. Soğuk su, kışın bazı göllerde ve göletlerde buz oluşturur, bu da içindeki organizmaların aktivitesini azaltır.
Akarsular ve nehirlerin sıcaklığı ve koşulları mevsimlere ve bölgelere göre değişkenlik gösterir. Suyun içinde yeryüzünün derinliklerinden su çeken akarsu kaynakları, ağızlardan daha soğuk sıcaklıklara sahiptir. Soğuk, kuzey iklimlerde, ılımlı koşullar ve sıcak, nemli yerlerde mevcut olan akarsular ve nehirler ortaya çıkar.
