Ökaryotik hücrelerde organeller, hücrede farklı işlevler gerçekleştiren zara bağlı yapılar ve prokaryotik hücreler yoktur. Bazı tipik ökaryotik organeller, çekirdek, mitokondri, ribozom, Golgi aparati ve kloroplastları içerir.
Ökaryotik hücreler prokaryotik hücrelerden daha organize ve karmaşıktır. Prokaryotik DNA sitoplazmada serbest bir şekilde yüzerken, ökaryotik DNA çekirdekte bulunur.
1970'lerde, Dr. Lynn Margulis, ökaryotik hücre organellerinin bir zamanlar daha büyük hücreler tarafından sarılmış prokaryotlar olduğu teorisini ortaya koydu. Daha büyük hücreler, daha küçük hücreleri korurken, daha küçük hücreler kendilerine yiyecek sağladıktan sonra konakçı haline geldi. Zamanla, ikisi de diğeri olmadan var olamazdı. Bu endosimbiyotik teori, mitokondri ve kloroplastlar gibi organellerin günümüzdeki bakterilere benzediğini gösteren kanıtlarla desteklenmiştir.
