Pineal bezin birincil işlevi, uyku döngüsünün düzenlenmesi ve cinsel gelişimde rol oynayan melatonin salgılamasıdır. Pineal bez ayrıca endokrin fonksiyonlarını düzenlemeye ve sinir sinyallerini endokrin sinyallerine dönüştürmeye yardımcı olur.
Uzun yıllar boyunca, bilim adamları ve doktorlar, endokrin organların geri kalanının fonksiyonlarını keşfettikten uzun süre sonra, epifiz bezinin gerçekte ne yaptığı konusunda kafaları karışmış durumda. Bilim adamları, epifiz bezinin vücutta oynadığı rolün tamamıyla tam olarak emin değiller, ancak şimdi esas olarak ürettiği tek bilinen hormon olan melatoninin salgılanması ile ilgisi olduğuna inanıyorlar.
Melatonin salgısı ışıkla düzenlenir, çünkü epifiz bezi karanlık olduğunda yüksek seviyeler üretir ve ışık olduğunda üretmeyi durdurur.
Pineal bez uzun zamandır beynin merkezine yakın olması nedeniyle “üçüncü göz” olarak bilinmektedir. Çam kozalağı şeklinde olan küçük, kırmızımsı gri bir organdır ve epifiz bezine adını veren bu şekildir. İnsanlar yaşlandıkça, epifiz bezi sıklıkla zamanla biriken fosfor, kalsiyum ve florür birikintileri nedeniyle kireçlenir.