Meyve sineği, Order Diptera'nın en küçük üyeleri arasındadır ve büyük, belirgin bileşik gözler, oval şekilli gövdeler ve daha büyük sinekler gibi dört kanattan oluşan bir kümeye sahiptir. uzunluğu milimetredir ve dişiler erkeklerden biraz daha büyüktür. Görünüşe göre birçok sinek türünü yakından andırıyorlar, aynı benzersiz vücut şeklini, büyük kanatları ve şişkin gözlerini paylaşıyorlar, ancak bazı temel biyolojik farklılıklara sahipler.
Meyve sineği, antenlerini örten minik kıl benzeri yapılar olan pektinat aristaları ile biyolojik olarak en yakın akrabalarından ayrılır. Meyve sinekleri, büyük kuzenlerine göre uçuşta kanatlarını daha hızlı ve agresif bir şekilde vurur; Diptera takımından diğerlerinde olduğu gibi, meyve sinekleri türe bağlı olarak renk çeşitliliği gösterir. Bazıları canlı ve canlıdır ve gövdeleri ve kanatları parlak turuncu, kızıl ve altın rengindedir, bazıları koyu mavi, gri ve siyahtır. Meyve sineği, vücut uzunluğunun iki katı büyüklüğünde uzun antenlere sahiptir. Bu antenler, uçları yiyecek kaynaklarına yönlendiren küçük duygularla donatılmıştır. Meyve sineği, birçok böcek gibi, esas olarak onlara 3-D görüşü veren bileşik gözlerin büyüklüğüne sahiptir