Bir zar proteininin işlevleri arasında hücre uyumu, bir hücrenin içi ve dışı arasındaki sinyalleri ileten ve proteinleri zar boyunca taşıyan aktarma bulunur. biyolojik membranlarla etkileşime girer. Her bir membran proteini türünün farklı bir işlevi vardır.
Her bir membran proteini, membran fosfolipidleriyle etkileşime giren bütünleşik membran proteinleri veya geçici olarak membrana yapışan ve elektron taşınmasına yardımcı olan periferik membran proteinleri olarak sınıflandırılabilir.
Bazı membran proteinleri hücrelerin birbirini tanımlamasına yardımcı olur. Bu özellikle bağışıklık sisteminin hücreleri için geçerlidir. Bağışıklık sistemi hücrelerinin birbirlerine saldırmasını önlemek için birbirlerini tanıması gerekir.
