Kaplumbağaların omurgaları vardır. Scholastic'a göre, kaplumbağalar sürüngenlerdir ve tüm sürüngenlerin omurgaları vardır. Bir kaplumbağanın kabuğu, hayvanın omurgasına, kaburgalarına, omuzlarına ve kalçalarına bağlı olan sırasıyla üst kısım ve alt kısımlara, kabuk ve plastronlara sahiptir.
Kabuğun her iki bölümü de lamina adı verilen ince pullarla kaplı küçük kemikli plakalardan oluşur. İnsan tırnaklarına benzer bir maddeden yapılırlar. Tartılar kaplumbağa kabuğu için renk - tipik olarak kahverengi, siyah veya yeşil -; ancak, bazıları daha renklidir. Örneğin, lekeli kaplumbağaların kabuklarında parlak renkli noktalar bulunurken, boyalı kaplumbağaların kabuklarının etrafında kırmızı, sarı veya turuncu kenarlık vardır.