Hidrojen atomunun bir protonu, bir elektronu ve nötronu yoktur. Bu hidrojen atomu aynı zamanda bir izotop olan protium olarak adlandırılır. Bu gaz elemanının atom sayısı 1'dir ve atom ağırlığı mol başına 1.00794 gramdır.
Evrenin yüzde 90'ından fazlası hidrojenden oluşuyor. Hidrojen nükleer füzyonda önemli bir rol oynar. Hidrojene, enerji kaynağı olarak güneş gibi birçok yıldız da ihtiyaç duyuyor.
Protium bir izotop olmasına rağmen, hidrojenin diğer iki izotopları döteryum ve trityumdur. Deuterium'un bir nötronu ve aynı sayıda elektron ve proton vardır. Trityumun iki nötronu ve bir proton ve elektron vardır. Trityum 12 1/2 yıllık yarı ömrü olan radyoaktif bir izotoptur.
