Hayvan barınaklarına bağışlar, evlat edinme ücretleri, talepler ve mal satışları desteklenir. Hayvan barınakları ayrıca fon toplamak için yıllık yürüyüşler ve akşam yemekleri gibi özel etkinliklere ev sahipliği yapar.
Belediyeler tarafından kontrol edilen hayvan barınakları hükümet tarafından finanse edilmektedir. Fonlar genellikle işletme maliyetlerini karşılamak için yeterli değildir. Bu barınakların genellikle ek giderlerini karşılamak için kar amacı gütmeyen şubeleri vardır.
Fon yaratma faaliyetleri ve etkinliklerinin yanı sıra bağışlar, özel, kar amacı gütmeyen hayvan barınaklarının ana gelir kaynaklarıdır. Animal Humane Society gibi hayvan barınakları, su tutmamış hayvanlara barınma sağlamak için şehirlerle anlaşarak finansman kazanıyor. Bu fonlar toplam işletme bütçesinin sadece yüzde 1'ini oluşturuyor. Özel barınaklara devletten hibe karşılığı verilmemektedir.
Amerikan Hayvanları Zulüm Önleme Derneği gibi kuruluşlar hayvan barınaklarına düzenli olarak hibe şeklinde destek vermektedir. Bu hibeler 500 ila 10,000 dolar arasında değişmektedir. Bu hibe için yalnızca talep edilen teklifler dikkate alınmaktadır. Amerikan İnsani Derneği açık bir başvuru süreci ile hibe sunar.
Bazı hayvan barınakları, bağış kutularının yerleştirildiği büyük süpermarket zincirleriyle ortaktır. Yılın farklı zamanlarında, gıda kaynakları, fonların altında barınakların çalışmaya devam etmesini sağlamak için mağazalarda düzenlenmektedir.