Fosiller hemen hemen her zaman tortul kaya tabakalarında bulunur. Tortul kayaçlar, Dünya yüzeyinde en bol bulunan türdür ve organik olarak korunması muhtemel koşullar altında oluşan tek türlerdir. eserler.
Sedimanter olmayan kayaçlar ya fosil toplayamazlar ya da oluşumları sırasında onları yok edebilirler. Magmatik kaya, Dünya kabuğunun erimiş bölgesinden dökülür ve yüzeyde ya da yakınında soğur. Obsidiyen ve pomza gibi magmatik kayaçların yüzeyleri volkanlardan patlar ve organik kalıntıları çekmeden önce serinler. Hala dövülebilirken temasta oldukları kemik, diş veya bitki maddeleri fosilleşmek için iz bırakmadan tamamen yanar. Plütonik granit gibi substrat magmatik oluşumlar, sıcak bir bolus içinde yüzeyin hemen altındaki bir noktaya yükselir ve biyolojik malzemenin herhangi bir noktada kayaya girmesini engelleyen yerde serinler.
Üçüncü kaya türü, metamorfik, zaman zaman içinde gömülü fosillerle bulunur, ancak bu olağandışıdır. Metamorfik kayaç genellikle kireçtaşı gibi bir tortu olarak başlar, ancak aşırı sıcaklık ve basınç koşulları altında bir reformasyon işlemine uğrar. Metamorfik koşullar sıklıkla fosilleri tahrip eder ve mermer gibi ortaya çıkan kaya, nadiren biyolojik varlık izlerine sahiptir.