Eubakteriler ve arkebakteriler çok çeşitli şekillere sahiptir. Ancak, bu hücre türlerinin zara bağlı organelleri yoktur, DNA'larını bir çekirdek halinde organize etmezler ve korunan hücre zarları tarafından tutulur hücre duvarları tarafından. Her ikisi de yapı olarak nispeten basittir, bu yüzden farklılıklarının çoğu yapısal değil kimyasaldır. Genelde, arkebakteriler, öbakterilerin yoksun olduğu ökaryotlarla ortak noktalara sahiptir, fakat aynı zamanda gerçekten eşsiz özelliklere sahiptir.
Arkebakterilerle karşılaştırıldığında, eubakteriler son derece çeşitli ve yaygındır, ancak yalnızca üç ana hücre şekline sahiptir. Ya küreseldir, kısa çubuk şeklinde veya uzun ve bükümlüdürler. Bu temel biçim, öbakterilerin nasıl sınıflandırıldığının büyük bir parçasıdır. Öte yandan, arkebakteriler şekillerine göre değil, aşırı uç tiplerine göre de sınıflandırılır. Arkebakteriler, ne ürkteriler ne de ökaryotların hayatta kalamayacağı düşmanca ortamlarda yaşar. Metan üreticileri, aşırı ısı uzmanları veya aşırı tuzluluk uzmanları olarak sınıflandırılırlar.
Bu aşırı ortamlarda arkapteriyellerin hayatta kalmasının bir kısmı, eşsiz hücre zarlarıdır. Tüm ökteria ve ökaryotlarda hücre zarları olarak fosfolipit iki tabakaları bulunurken, arkebakterlerde zarları için gliserole eter bağlantıları olan dallanmış hidrokarbon zincirleri vardır. Bu eşsiz membran tipi diğer yaşam formlarından daha kararlıdır ve aşırı koşullara dayanmalarını sağlar.
