Motor nöronlar sinyalleri vücuttaki kaslara ve bezlere iletir. İki ana tür vardır: gönüllü kas hareketlerini kontrol eden somatik motor nöronları ve istemsiz kas hareketlerini ve bezlerini kontrol eden otonom motor nöronları. Otonom motor nöronları ayrıca sempatik ve parasempatik sistemlere ayrılmıştır.
Somatik motor nöronları, merkezi sinir sisteminde ya beyin, beyin sapı ya da omurilikte bulunan hücre gövdelerine sahiptir. İskelet kaslarına kadar uzanıyorlar. Bunlar genellikle gönüllü olarak kontrol edilirken, bazı uyaranların bu nöronların istemeden ateşlenmesine neden olduğu durumlarda bazen refleks yaylar ortaya çıkar. Bu durumda, bir duyusal nöron, genellikle bir ağrı sinyali olan bir uyarıcıyı uyarır; bu, uyarıcıların sadece beyne gitmesini değil, aynı zamanda bir interneuron aracılığıyla doğrudan bir motor nöronuna da yol açar. Bu, diz çökmesi refleks testindeki istemsiz hareketin nedenidir.
Sempatik sistemdeki otonom motor nöronları istem dışı kasları veya salgı bezlerini aksiyonlara uyarırken, parasempatik sistemde bu eylemleri engeller. Bu nöronların hücre gövdeleri merkezi sinir sisteminde değil, bunun yerine periferik sinir sisteminde ganglion adı verilen sinir hücrelerinin kümelerinde bulunur.
