Pokémon'da kesin bir “en iyi” takım bulunmasa da, her nesilde istatistiklerini, savaştaki etkinliğini ve diğer Pokémon'lara göre sıralamasını temel alan en iyi Pokémon'u sıralayan sıra listeleri vardır. Her hamlede yeni hamleler, yeni Pokémon ve yeni tip eşleşmeler nedeniyle bu seviyeler her oyunda değişiyor. Pokémon Emerald için en iyi Pokémon, üçüncü nesil uber seviyedekilerdir.
Pokémon'da dokuz resmi katman var: tamamen gelişmemiş, küçük bardak, hiç kullanılmamış, sınırda 3, nadiren kullanılmış, sınırda 2, az kullanılmış, sınırda, aşırı kullanılmış ve uber. Uber kademe en güçlü Pokémon'u içerir. Üçüncü nesil über kademe, Wobbuffet ve Wynaut hariç tamamen efsanevi Pokémon'dan oluşuyor. Bunlar Mewtwo, Mew, Lugia, Ho-oh, Latias, Latios, Kyogre, Groudon, Rayquaza ve tüm Deoxys biçimlerini içerir. Bununla birlikte, bunun üçüncü nesil Pokémon'da mevcut 17 tipten sadece 6'sını içerdiğini belirtmekte fayda var. Bu nedenle, sadece bu Pokémon'u içeren bir takım, diğer tür takımlarla sadece tip dezavantajları nedeniyle iyi eşleşmeyebilir. Pokémon'u daha çeşitli aşırı kullanım seviyelerinden kullanmaya değer olabilir. Bunlar Gengar, Rhydon, Umbreon ve Raiku gibi Pokémon'ları içerir. EV eğitimini ve yeteneklerini göz önünde bulundurmak da önemlidir. Uygun bir eğitim ile, alt kademelerden birinden bir Pokémon bile bir çocuğa dayanabilir ya da fazla kullanılamaz.