Serotonin eksikliğinin fiziksel belirtileri arasında devam eden yorgunluk, uyku bozuklukları, karbonhidratlar için bir özlemle birlikte iştahsızlık, baş ağrıları ve dalgalı vücut ısısı, Progressive Health'e göre değişebilir. ayrıca gastrointestinal ağrı da yaşar.
Progressive Health'e göre, serotonin seviyesinin düşük olduğu kişilerde, hastanın aktivite seviyesinden bağımsız olarak kronik ve kalıcı yorgunluk oluşabilir. Hasta uykuya dalmakta hızlı olsa da, artan endişe nedeniyle uykuya dalmakta zorluk çekebilir. Vücudun tipik olarak serotonin üretiminden sorumlu olan karbonhidratlar için özleminin bir sonucu olarak iştah kaybına rağmen kilo alımı olabilir. Bu sindirim ve gastrointestinal faktörlerin bir araya gelmesi, artan miktarlarda insülin üreterek kilo alımına neden olabilir. Gastrointestinal ağrı tipik olarak, introkin enterokromaffin hücrelerinin serotonin salgılayamadığı sonucu ortaya çıkar.
Serotonin eksikliği olan hastalar, Progressive Health'e göre tipik olarak sıcak basmaları yaşarlar. Hipotalamustaki serotonin eksikliğini telafi etmeye çalışan nörotransmiterler aşırı tepki verebilir ve vücudu normal sıcaklığının ötesinde ısıtabilir. Düşük serotonin seviyeleri tipik olarak sık migren ve baş ağrısı ile sonuçlanan metabolik bozukluklara neden olur. Düşük serotonin tedavileri arasında düzenli egzersiz yapmak, bol miktarda güneş ışığı almak, düşük glisemik indeksli karbonhidratlar yemek ve serotonin takviyesi almak sayılabilir.