1945'te Doğu Prusya dağıldı ve topraklar Polonya, Rusya ve Litvanya arasında dağıldı. Bu nedenle, eski eyalete bir bütün olarak atıfta bulunan tek bir isim yoktur.
II. Dünya Savaşı'nın sonunda Potsdam Konferansı sırasında Doğu Prusya yeniden dağıtıldı. Bu konferans sonucunda Sovyetler Birliği'ne kuzey Prusya'nın kuzeyine, Polonya ise güney topraklarının çoğunu emdi. Eski Konigsberg de dahil olmak üzere, Doğu Prusya'nın kuzey topraklarının çoğu, şimdi Rusya'nın Kaliningrad Oblastı'nın bir parçası. Kuzey Doğu Prusya'nın kalan bölgeleri Litvanya tarafından eklenmiştir. Ülkenin kuzey sınırındaki Baltık Denizi'ne erişmesine izin veren Polonya'ya Güney Doğu Prusya verildi.