Mercan Denizi Savaşı, Japonların Yeni Gine'deki Port Moresby'yi işgal etme girişimlerini engelleyerek Japonya ve Avustralya arasında güvenli bir bölgeden mahrum kalmasına yol açtı. History.com'a göre, denizde uçak gemilerinden başlatılan uçakların hayati bir rol oynadığı tarihte ilk hava-deniz savaşıydı.
Japonca kodunu kırma girişimlerinin başarılı olması nedeniyle, Müttefikler, Japon Port Moresby'yi işgal etmeleri konusunda önceden uyardılar. Solomon Adaları'ndaki Tulagi'deki bir deniz uçağı üssüne zarar verdikten sonra, Arka Amiral Frank J. Fletcher liderliğindeki bir Müttefik filosu Mercan Denizi'ne doğru koştu. Japon uçakları, yıkıcı USS Sims'e zarar verdi ve battı ve yağlayıcı USS Neosho'ya hasar verdi. Buna karşılık Müttefik uçakları Japon uçak gemisi Shoho'yu batırdı ve uçak gemisi Shokaku'ya ağır hasar verdi. Amerikalı taşıyıcı USS Lexington, bombalar ve torpidolar tarafından defalarca vuruldu, ateş aldı ve yakalanmamak için battı. Sonunda, Japon komutanı istila filosunun geri çekilmesini emretti.
Her iki taraf da ağır kayıplara uğradı. Gemilerin batması ve hasar görmesinin yanı sıra, 543 Müttefik kuvvet ve 1.074 Japon kuvvet öldürüldü. Müttefik çaba, Japonların Güney Pasifik'teki saldırılarını engelledi ve Japon havayolu filosuna önemli ölçüde zarar veren ve savaş girişiminin Amerikalılara geçmesine neden olan Midway Savaşı'nın sonucunu etkiledi.
