Çok fazla portakal suyu içmek, vücudu olumsuz yönde etkileyebilir. Portakal suyu doğal fruktoz veya şeker içerir. Günlük birkaç bardak portakal suyu içmek, diyetteki kalori sayısının artması nedeniyle kilo alımına neden olabilir.Portakal suyu ayrıca mide yanması veya asit geri akışından muzdarip insanları etkileyen sitrik asit içerir. Hassas kişilerde şiddetli karın ağrısı ve kusmaya neden olabilir.
Çok fazla portakal suyu da duyarlı kişilerde gut oluşmasına neden olabilir. Gut, eklemlerde ürik asit birikmesinden kaynaklanır. Yüksek fruktoz içeriği nedeniyle portakal suyu vücutta aşırı ürik aside neden olabilecek yiyecek ve içeceklerden biridir.