Çayır köpeği, büyük ölçüde kentsel ve tarımsal gelişmeden kaynaklanan habitat kaybı nedeniyle tehlikeye girmiştir. Her biri veba dahil olmak üzere farklı nedenlerden dolayı tehlike arz eden çeşitli çayır köpekleri vardır.
Kara kuyruk çayır köpeği 2014'ten itibaren neredeyse soyu tükenmiştir. Bu durum ilk olarak vebaya bağışıklığı olmadığı için kullanıldı. Gunnison'un Çayır Köpeği, veba, toprak geliştirme ve gaz ve petrol sondajı ile tehdit edildi. Tarım alanlarındaki yaşam alanı kaybı, Meksikalı çayır köpeğini tehlikeye attı. Utah çayır köpeği, hayvanların otlatılması, veba ve habitat kaybı ile tehdit edildi. 2010 itibariyle, ABD Fish & Yaban Hayatı Servisi, Tehlike Altındaki Türler Yasası uyarınca beyaz kuyruklu çayır köpeği korumalarını reddetti.