Çoğu insan, CAT taramalarında kullanılan kontrast boyaya karşı ciddi reaksiyonlara sahip olmamakla birlikte, enjekte edilirken en yaygın görülen yan etkiler, Imaginis'e göre sıcak flaşlar ve ağızda metalik bir tat vardır. Bazı hastalar ayrıca, vücutta atıştan birkaç dakika veya hatta birkaç saat sonra ortaya çıkabilen kaşıntılı kovanlar da yaşarlar. Nadir durumlarda, nefes almada zorluk ve boğazın şişmesi veya vücudun diğer bölgeleri gibi acil tedavi gerektiren daha ciddi yan etkiler bildirilmiştir.
Yan etkiler, iyot içeriğinden dolayı geleneksel kontrast boya ile daha sık görülür. Bununla birlikte, farklı iyot kimyasal yapıları içeren yeni "iyonik olmayan" kontrast formları, Imaginis tarafından belirtildiği gibi tipik olarak daha az yan etkiye neden olur.
Bir CAT taraması sırasında, belirli organları vurgulamak için kontrast madde kullanılır, taramayı okurken hastalık veya yaralanma belirtilerini daha görünür hale getirmeye yardımcı olan diğer dokuları kan damarları içine alır. Enjekte edildiğinde, boya doğrudan bir damar içine yerleştirilir, bunun ardından dolaşım sistemi içinden geçerek en sonunda karaciğer ve böbrekler tarafından vücuttan ayrılıncaya kadar dolaştırılır. Enjeksiyonlara ek olarak, boyalar da oral olarak, rektal olarak ve çok nadiren inhalasyon yoluyla verilir.
