Lizozomlar, yabancı maddeleri parçalayan sindirim maddeleri içerir. Lizozomlardaki sindirim maddeleri, ribozomlarda yapılan enzimler, protein yapan organel tipleri ve kaba endoplazmik retikulum adı verilen bir yapı üzerinde bulunur. Bu enzimler Golgi apparati adı verilen diğer organeller tarafından lizozomlara paketlenir.
Lizozomlardaki enzimler, proteinler, karbonhidratlar, yağlar ve nükleik asitler gibi biyolojik maddeleri bozar. Bu maddeler eski bir organelden, bir yiyecek kaynağından veya virüs gibi bir yabancı maddeden gelebilir.
Birincil lizozomlar Golgi cihazında ortaya çıkar. Bu lizozomlar, ikincil lizozomlar haline gelmek için fagosomlarla birleşir. Fagozomlar, bir hücrenin plazma zarının bir parçası bir gıda parçacığını sardığında ve sardığında oluşan veziküllerdir. Sindirim enzimleri daha sonra lizozomun kaynaşmasından fagosomlara girerek fagogomun içeriğini parçalamaktadır.