Biyokimyasal testler bakterileri tanımlamak için en hızlı ve en kolay testlerdir çünkü çok hızlı bir şekilde bulunan olası tür sayısını azaltmak için tümdengelim prensiplerini kullanırlar. ve asla kolay değildir. Bazı tanınmış bakteriler için genetik test yapılması mümkündür, ancak pahalıdır ve zaman alıcıdır.
Bakteriler için basit bir biyokimyasal test, katalaz testidir. Potansiyel bakteri türlerinin havuzunu azaltmanın en iyi yollarından biri, söz konusu türün anaerobik olup olmadığını belirlemektir, yani metabolizmasında oksijen kullanmadığı anlamına gelir. Testi yapmak için, teknisyenler bakteri yüklü bir slaytı az miktarda hidrojen peroksite maruz bırakmaktadır. Teknisyenler daha sonra kabarcıkları bulmak için mikroskop yardımıyla slaydı gözlemler. Kabarcıklar, bakterilerin oksijeni metabolize edebildiğini ve anaerobik bakteri olmadığını gösterir.
Mikrobiyologlar, ellerinde bakterilerin kimliklerini belirlemelerine yardımcı olabilecek birçok farklı biyokimyasal teste sahiptir. Genellikle, bir örneği pozitif olarak tanımlamak için birden fazla test gerekir. Bakterilerin kaynağı, kimliği hakkında birçok ipucu sağlayabilir. Benzer örnekleri rutin olarak test eden teknisyenler genellikle mümkün olan en az miktarda test kullanma becerisi kazanırlar.