Başkan Andrew Johnson’ın Yeniden Yapılanma planları, Başkan Lincoln’ün planlarıyla aynıydı: Birlik bir araya gelecek ve Güney cezalandırılmamalı. Savaşta yer aldı, ABD'ye bağlılık sözü verdi. Cumhurbaşkanı, devletin beyaz seçmenlerinin yüzde 10'unun sadakat sözü vermesi durumunda sendikaya girdi. Sendikaya yeniden katıldıktan sonra, hükümetlerini köleleştirmeden reform yapmalarına izin verdi.
Yeniden yapılanmadaki bu büyük adımlara rağmen, Johnson güçlü Cumhuriyetçi parti ile desteklenmedi veya popüler değildi. Cumhuriyetçi parti, serbest bırakılan kölelerin korunmasına ve sendikaya yeniden girmenin zorlaştırılmasına daha fazla vurgu yapılmasını istedi. Dahası, Cumhuriyetçiler, güney eyaletlerinin eski kölelerin özgürlüklerini sınırlandırmak için yasaları ne kadar çabuk geçirdikleri konusunda endişeliydi. Andrew Jackson ve Kongre birlikte iyi çalışmadı. Yeniden Yapılanma için planlarını reddettiler ve Jackson da planlarını veto etti. Ancak Kongre, İmar planlarını yeterince büyük bir marjla oy kullanabildi. Kongre aynı zamanda, Jackson’ın başkanlık yetkisini, Görevde Bulma Yasası’nın geçişi ile sınırlandırdı. Bu, Jackson’ın artık federal atamaları kaldıramadığı anlamına geliyordu. Jackson zaten Savaş Sekreteri Edwin Stanton ile yaptığında, Kongre onu etkilemeye çalıştı. Meclis bunu yapmak için oy kullandı, ancak oylar Senato’da kısa bir süre kaldı. Bu çekişme 1869'da Ulysses S. Grant'in başkan olduğu ve Kongre Yeniden Yapılandırma planlarını tam olarak desteklediği zaman sona erdi.
