Penn State Ziraat Bilimleri Koleji'ne göre, su yumuşatmasının en büyük dezavantajı, sudaki yumuşatıcı bir kişinin sodyum alımını artırabileceğinden, düşük sodyum diyetleri olan insanlar için potansiyel sağlık riskidir. Ayrıca, yumuşak su içmek için uygun değildir. Metaller suda kısmen çözünür olduğu için, su yumuşatıldığında, metalleri su hatlarından çok daha agresif bir şekilde geçirir.
Aquatechnology, yumuşak suyla, bir musluktan soğuk suyun ilk çekilişinin normal kurşun içeriğinin üzerinde olması ihtimalinin yüksek olduğunu açıklar. Bu nedenle, musluktaki yumuşatılmış su içmek veya yemek pişirmek için kullanılmamalıdır. Su yumuşatıcıları kurşun ve diğer metallerin, klorin ve klorin yan ürünlerinin giderilmesinde etkili değildir.
Ayrıca, Aquatechnology, sodyum veya potasyum klorür bileşiğinin yumuşak suda bulunan klorür bileşeninin, insanların ve bitkilerin hidrasyonu için ciddi etkilerinin bulunduğunu, çünkü potasyum ve klorürün, suyun vücut hücrelerine serbest akışını kısıtladığını belirtir. BBC, yumuşatılmış suyun sadece çamaşır yıkamak için kullanılması gerektiğini belirtir.Su yumuşatıcılarının kullanımı da pahalıdır, çünkü teslim edilen her 1000 galon için 120 galon boşa harcarlar. Bakım başka bir konudur. Penn State Ziraat Bilimleri Fakültesi, özel özelliklere sahip modeller için her ek özellik için ödeme yapmanın gerekli olduğunu belirtir.