Uzun, uzuvsuz bir vücuda sahip olmak için yapılan bazı adaptasyon yılanları, diğer hayvanlarınkinden çok farklı şekilde düzenlenmiş iç organlardır. Örneğin, bir akciğer genellikle diğerinden çok daha büyüktür. Bazı yılanlarda, küçük akciğer zar zor işlev görür.
Yan yana yatmak yerine, böbrekler, yumurtalıklar ve testisler arka arkaya düzenlenir. Sağ organ genellikle solun önündedir ve genellikle ikisinin büyüğüdür; bu organlar da uzundur. İdrar kesesi gibi bazı organlar elimine edilmiştir.
Yılanın omurganın destekleyebileceği bir uzuv olmadığı için, pek çok omurun neredeyse hepsi aynıdır. Bir yılan 400 kadar vertebraya sahip olabilir ve omurganın güçlü ve yılanın oldukça esnek olması için birbirine kenetlenirler.
En dikkat çekici uyarlamalardan biri yılanın kafasındadır. Katı bir çene kemikleri yerine, yılan bağlarla gevşek bir şekilde birleştirilen ve hayvanın kafasından çok daha büyük bir avını yutmasına izin verecek şekilde eklem yapabilir. Yılanın dişleri sadece avını tutmak için yapılır ve çiğneyemez. Başlarına gevşek bir şekilde yerleştirilmişler, kolayca düşüyorlar ve hayvan ömrü boyunca değiştiriliyorlar.