Songhai İmparatorluğu'nun çöküşüne katkıda bulunan faktör, 1591'de patlak veren bir iç savaştı. Bu, Fas'ın orta çağ Batı Afrika krallığını işgaline yol açtı.
Songhai İmparatorluğu, Mali İmparatorluğu'nun düşüşü sırasında ortaya çıktı ve Batı Afrika'daki sömürge öncesi üç alan arasında en son ve en yaygın olanıydı. Krallık, başkenti Nijer Nehri'nde bulunan ve ana geçim kaynağı ticarete odaklanan Gao'da kuruldu. Askeri lider Sünni Ali Ber, geniş toprak genişlemeleri için itibar kazanan imparatorluğun ilk yöneticisi oldu. 1591'de Sultan II. El Mansur Saadi'nin önderlik ettiği Fas'ın işgaline yol açan ve sonunda Songhai İmparatorluğu'nun çöküşüne yol açan bir iç savaş meydana geldi.