Monera krallığı bakteriler ve siyanobakteriler içeriyordu. DNA dizilimi gibi teknolojiler organizmalar arasındaki ilişki hakkında yeni bilgiler verdiğinde sınıflandırma sistemleri değişir. Bakteriler, Archaea ve Eukarya'dan oluşan üç alanlı bir sistem beş krallık sistemini destekledi ve Monera eskidi.
Bir fonksiyonel sınıflandırma sistemi organizmaları genomlarından ziyade hücre tiplerine göre böler. Bakteriler, hücrelerinde çekirdek ve zarla kaplı organellerin bulunmamasıyla ayırt edilen prokaryotlara aittir. Prokaryotların çoğu, yalnızca mikroskop altında görünen tek hücreli organizmalardır. Ökaryotlar protistler, mantarlar, bitkiler ve hayvanları içerir. Archaea, benzer genleri içeren ökaryotlarla bazı özellikleri paylaşan prokaryotlardır.
