Çoğu kırkayak cinsel döllenme yoluyla cinsel olarak çoğalır. Kesin yöntem türler arasında farklılık gösterir ve kur davranışını veya feromon kullanımını içerebilir veya içermeyebilir.
Kırkayaklarda, yumurta ve sperm hücreleri, hayvanların üçüncü vücut bölümlerinde gonoporlardan kaynaklanır. Erkek kırkayaklar, yedinci vücut bölümündeki gonopod olan sekonder bir cinsel organa sahiptir ve spermin gonoporlardan gonopod'a kopopülasyondan önce aktarılması gerekir.
Kıllı erkek kırkayaklar, üzerine sperm bırakacak bir tür ağ oluşturur. Dişi spermi alır ve kendini döllenir. Kur yapma davranışına sahip türlerde, erkek, ilgiyi canlandırmak için kadının sırtına yürür. Dişi alıcı ise, baş bölgesini yükseltir ve erkeğin kendisini dolaştırmasına izin verir. Erkek spermi dişi üreme yapısına küçük bir paket veya sperm yoluyla geçirir. Feromonları kullanan türlerde, kimyasalların yalnızca kısa mesafeli iletişim için etkili olması muhtemeldir. Dişi yumurtalarını kir veya yapraklara bırakır ve bazı türlerde yumurtadan çıkana kadar onları korur.
İki tür kılcal kırkayak partenogenik üreme yeteneğine sahiptir. Erkekler bu türlerde nadirdir veya yoktur ve üreme aseksüeldir, bu da annenin esas olarak klonları olan genç ile sonuçlanır.
