Mega Blokslar genellikle LEGO ile tamamen uyumludur. Mini Mega Blokslar, LEGO'nun Duplo ve standart blokları ile uyumludur ve maxi blokları Duplo ile uyumludur.
Uyumlu olmalarına rağmen, bazı eleştiriler Mega Bloks'un LEGO'ya göre daha düşük kaliteli bir marka olduğunu belirtiyor. Düşük kalite nedeniyle, Mega Bloks saplamalarında ve LEGO ile her zaman uygun şekilde uyum sağlamayan deliklerde tutarsızlıklar vardır. Uyumluluk, tuğlaların 3B yapılı modellerin aksine doğrudan üst üste yerleştirilmesiyle en iyi şekilde çalışır. LEGO daha dayanıklı bir ürün olarak kabul edilir, ancak Mega Bloks çok daha ucuzdur.
