Lewis ve Clark, Rocky Dağları'nın kuzeyindeki bir bölge olan Bitterroot Sıradağları'nı geçtiler. 5,236 fit yükseklikte olan Lolo Geçidi.
Lewis ve Clark'ın seferinin ana hedeflerinden biri, Atlantik Okyanusu'ndan Pasifik Okyanusu'na olan varsayımsal bir su yolu olan Kuzeybatı Geçidi'ni aramaktı. Diğer hedefler arasında Yerli Amerikalılarla diplomatik temas kurmak, kürk ticaretini yeni bölgelere yaymak ve Missouri Nehri, Kuzeybatı Pasifik ve yeni satın alınan Louisiana Satın Alma'yı keşfetmek vardı. Mayıs 1804'te Missouri Nehri'ni 33 erkekle birlikte kurdular. Kuzey Dakota'da, kışı beklemek için Mandan Kalesi'ni inşa ettiler. 1805 Nisan'ında, at sırtında devam etmeleri gereken Rocky Dağları'na ulaşana kadar Missouri boyunca devam ettiler. Kıta Dividinin diğer tarafında, Clearwater ve Snake Rivers'da kano ile Columbia Nehri'ne ulaşana kadar kanoyla devam etti ve bu da onları Pasifik'e kadar götürdü.
Lewis ve Clark ve keşif kolordu olarak adlandırılan keşif adamları, yaklaşık 8.000 mil seyahat ettikten sonra, Eylül 1806'da St. Louis'e geri döndü. Başkan Thomas Jefferson, Kongre ve Amerikan halkı tarafından kahraman olarak kabul edildiler.
