Bir kolonoskopi WebMD’yi belirtiyorsa 30 ila 60 dakika sürebilir. İşlem için verilen yatıştırıcılardan iyileşmek için bir saat sürebilir ve hastalar sedasyondan 12 saat boyunca yasal olarak bozulmuş sayılır . Güvenilir bir kişi hasta evine eşlik etmelidir.
Prosedüre götürmek için gereken hazırlık süresi de vardır. Mayo Clinic'e göre, tipik olarak, hastanın işlemden bir gün önce katı yiyecekler yemesine izin verilmez ve işlemden üç saat önce berrak sıvı içmeyi bırakması gerekir. Bazı doktorlar, kolonu temizlemek için müshil veya lavman kullanılmasını önerir. Hastaların ayrıca bazı ilaçları ameliyattan bir hafta öncesine kadar ayarlamaları gerekebilir.