Klorofil molekülü ışığı absorbe ettiğinde kararsız hale gelir ve nispeten serbest hareket eden elektronlarına enerji verilir ve karbonhidrat üreten moleküllere bağışlanır. fotosentezi destekleyen enerji. Karbonhidrat, karbondioksit ve sudan elde edilen enerji ile üretilir ve atık gaz olarak oksijen üretir.
Klorofil, bir azot atomu halkasını çevreleyen bir dizi siklik hidrokarbondan oluşan bir ana gruba sahip kompleks bir moleküldür. Azot atomlarının kendileri tek bir magnezyum atomunu çevreler. Azot atomlarının etrafındaki karbon halkaları, tek ve çift bağlar arasında değişmektedir ve elektronlar, bir kısımdan diğerine nispeten serbest bir şekilde akmaktadır. Bu ve kısmen magnezyumun elecronegativitesinin çok düşük olmasından dolayı, molekül elektronları çok kolay bir şekilde kaybeder. Klorofil ışığı emdiğinde elektron döken, yapraklardaki özel molekülleri karbondioksit ve su moleküllerini parçalamalarını ve kurucu elementleri arasında yeni bağların oluşmasını sağlayacak şekilde değiştirir.
Klorofil sadece kırmızı ve mavi ışık dalga boylarını güçlü bir şekilde emer ve bu nedenle, sadece bu renkler aslında fotosentezi güçlendirmek için yeterli enerji sağlar. Bu arada yeşil ışık, kırmızı karotenoidler gibi yapraklardaki diğer pigmentlerin tamamen gizlenebileceği şekilde klorofil tarafından çok kuvvetli bir şekilde yansıtılır.